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Text File  |  1995-03-04  |  2.3 KB  |  49 lines
  1. ****************************************************************
  2. * Gram-positive cocci surface proteins 'anchoring' hexapeptide *
  3. ****************************************************************
  4.  
  5. Surface  proteins from  gram-positive cocci  contains a  conserved hexapeptide
  6. located a few residues downstream of a hydrophobic  C-terminal membrane anchor
  7. region which is followed by a cluster of basic amino acids [1]. This structure
  8. is represented in the following schematic representation:
  9.  
  10.   +--------------------------------------------+-+--------+-+
  11.   |    Variable length extracellular domain    |H| Anchor |B|
  12.   +--------------------------------------------+-+--------+-+
  13.  
  14.   'H': conserved hexapeptide.
  15.   'B': cluster of basic residues.
  16.  
  17. It has been proposed that this hexapeptide sequence is responsible for a post-
  18. translational modification necessary for the  proper anchoring of the proteins
  19. which bear it, to the cell wall.
  20.  
  21. Proteins known to contain such hexapeptide are listed below:
  22.  
  23.  - Aggregation substance from streptococcus faecalis (asa1).
  24.  - C5a peptidase from Streptococcus pyogenes (scpA).
  25.  - C protein alpha-antigen from Streptococcus agalactiae (bca).
  26.  - Cell surface antigen I/II (PAC) from Streptococcus mutans.
  27.  - Fibronectin-binding protein from Staphylococcus aureus (fnbA).
  28.  - Fimbrial subunits from Actinomyces naeslundii and viscosus.
  29.  - IgA binding protein from Streptococcus pyogenes (arp4).
  30.  - IgA binding protein (B antigen) from Streptococcus agalactiae (bag).
  31.  - IgG binding proteins from Streptococci.
  32.  - Internalin A from Listeria monocytogenes (inlA).
  33.  - M proteins from streptococci.
  34.  - Muramidase-released protein from Streptococcus suis (mrp).
  35.  - Protein A from Staphylococcus aureus.
  36.  - Trypsin-resistant surface T protein from streptococci.
  37.  - Wall-associated protein from Streptococcus mutans (wapA).
  38.  - Wall-associated serine proteinases from Lactococcus lactis.
  39.  
  40. -Consensus pattern: L-P-x-T-G-[STGAVDE]
  41. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  42.  for C5a peptidase which has L-P-T-T-N-D.
  43. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 87  proteins  from  archaebacteria,
  44.  eukaryotes, or viruses, but only 17 other prokaryotic proteins.
  45. -Last update: June 1994 / Text revised.
  46.  
  47. [ 1] Schneewind O., Jones K.F., Fischetti V.A.
  48.      J. Bacteriol. 172:3310-3317(1990).
  49.